买个jr pass吧，东京到大阪来回一趟就回本了。坐新干线ひかり号，东京到大阪京都也就两个小时。你可以先游东京，然后找个晚上新干线到大阪，然后大阪玩几天，京都玩几天，然后再返回京都。不过jr pass有7天和14天，你时间不长的话7天比较合适，可以指定哪天开始用。

没行李可以廉航，对体力精力有自信可以夜行巴士

大巴，便宜的5000单程就差不多够了

http://jorudan.co.jp/或http://www.hyperdia.com/自己一段一段计算是自由行的基本功之一呀！不想动脑子的话直接买票。